De functie van directeur-bestuurder wordt vervuld door dr. Leonore Tuijt.
De Raad van Toezicht (RvT) van de Erasmus MC Foundation heeft tot taak toezicht te houden op het beleid van de directie en op de algemene gang van zaken in de stichting. De RvT-leden ontvangen geen vergoeding voor hun taken.
De RvT bestaat uit de volgende leden:

Mr. R.B. Gerretsen
Voorzitter - Co-head Corporate Litigation bij Windt Le Grand Leeuwenburgh
Erasmus MC Foundation
Dr. J.G. Boonstra
Vice-voorzitter Raad van Bestuur Erasmus MC
Erasmus MC Foundation
Prof. mr. T.J. Mellema-Kranenburg
Erasmus MC Foundation
Drs. O.F.J. Paymans
Eigenaar 4P Consultancy
Erasmus MC Foundation